RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325942.10

FRAS1-201, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRAS1, Length 7,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-201ENST00000325942 ITGA9Q13797 1035 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TTPALQ9BTX7 342 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ATP5HO75947 161 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CATP04040 527 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 KELP23276 732 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 NUMA1Q14980 2115 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 DLK2Q6UY11 383 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 LCN9Q8WX39 176 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 OR51B6Q9H340 312 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF222Q9UK12 451 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 J3QRK9 145 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TLR5O60602 858 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CSN2P05814 226 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ALOX12P18054 663 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 DGKAP23743 735 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PIK3R1P27986 724 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CD302Q8IX05 232 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 DNERQ8NFT8 737 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CMTM6Q9NX76 183 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 L1RE1Q9UN81 338 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 FAM187AA6NFU0 413 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TNFRSF10BO14763 440 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TULP3O75386 442 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 MUTP22033 750 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 OTX2P32243 289 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PLGLAQ15195 96 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 C8orf48Q96LL4 319 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 RNF145Q96MT1 663 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CHID1Q9BWS9 393 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 RAD54BQ9Y620 910 aa9.6□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ISPDA4D126 451 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 FPGTO14772 594 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM24O15164 1050 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TNFP01375 233 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CYP11B1P15538 503 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CD151P48509 253 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ENPEPQ07075 957 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 MYBPC2Q14324 1141 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM63Q969Q1 353 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SLC32A1Q9H598 525 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 H3BUI4 141 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 KLHL2O95198 593 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 SELPP16109 830 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 AQP1P29972 269 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 WDR49Q8IV35 697 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ITCHQ96J02 903 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 NMUR1Q9HB89 426 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CEP170Q5SW79 1584 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 PCDHGA12O60330 932 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 UGT1A5P35504 534 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 FRS2Q8WU20 508 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 COMMD9Q9P000 198 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 A0A1W2PRU2 124 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 ARL5CA6NH57 179 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 F8VP50 259 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 LAG3P18627 525 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 FUT4P22083 530 aa9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
FRAS1-201ENST00000325942 RTP1P59025 263 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms