RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 FBXO5Q9UKT4 447 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 PPP6CO00743 305 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 MTSS1O43312 755 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 CD4P01730 458 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 CHRM3P20309 590 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 SLC12A2P55011 1212 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 PCSK7Q16549 785 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 STON2Q8WXE9 905 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 PBXIP1Q96AQ6 731 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 ZFP42Q96MM3 310 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.84■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 IPO13O94829 963 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 DNAJB13P59910 316 aa21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 FAM83EQ2M2I3 478 aa21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 LINC00523Q86TU6 105 aa21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 FAM210AQ96ND0 272 aa21.83■■□□□ 1.09
ELL3-201ENST00000319359 NME4O00746 187 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 HCAR3P49019 387 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 CDH13P55290 713 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SV2CQ496J9 727 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 FNDC8Q8TC99 324 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 RNF34Q969K3 372 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TOP1MTQ969P6 601 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 VAT1Q99536 393 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 RAD54BQ9Y620 910 aa21.83■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 COL1A2P08123 1366 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 OXTRP30559 389 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PFKPQ01813 784 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 OR2T3Q8NH03 318 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 EXT2Q93063 718 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 FBXL20Q96IG2 436 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ASB14A6NK59 587 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 NR5A2O00482 541 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 MAPRE2Q15555 327 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TBCELQ5QJ74 424 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ERMP1Q7Z2K6 904 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TAC4Q86UU9 113 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 FAM35AQ86V20 835 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 OFCC1Q8IZS5 231 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ANKFN1Q8N957 763 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PCED1BQ96HM7 432 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SLC25A23Q9BV35 468 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 MAP10Q9P2G4 905 aa21.82■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 A0A087X1B8 175 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 NEPROQ6NW34 567 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 GPR141Q7Z602 305 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ALG9Q9H6U8 611 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TREX1Q9NSU2 369 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 SUPT7LO94864 414 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ATE1O95260 518 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 BMP10O95393 424 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PIM3Q86V86 326 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 LZTR1Q8N653 840 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 TCF12Q99081 682 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 GLOD4Q9HC38 313 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 DSEQ9UL01 958 aa21.81■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 HLA-DQB2P05538 268 aa21.8■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 BMP2P12643 396 aa21.8■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ELL3-201ENST00000319359 PNPLA4P41247 253 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms