RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295992.7

PCOLCE2-201, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCOLCE2, Length 2,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2-201ENST00000295992 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 HERVK_113Q902F9 699 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMEM209Q96SK2 561 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 IGSF5Q9NSI5 407 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 DTNAQ9Y4J8 743 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CEP290O15078 2479 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZBBXA8MT70 800 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 AP1G1O43747 822 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 BRCC3P46736 316 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SATB1Q01826 763 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PELI3Q8N2H9 469 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 RIMS3Q9UJD0 308 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 FBXO5Q9UKT4 447 aa23.42■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TCAF2A6NFQ2 919 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMEM233B4DJY2 109 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHRNA4P43681 627 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 POU4F1Q01851 419 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 LIN52Q52LA3 116 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZFP1Q6P2D0 407 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 UGT2A3Q6UWM9 527 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MFN1Q8IWA4 741 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MARK4Q96L34 752 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 OMDQ99983 421 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 WDR41Q9HAD4 459 aa23.41■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 M0QZQ0 153 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PAMP19021 973 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PGFP49763 221 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MS4A2Q01362 244 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ADGRE1Q14246 886 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 FLOT2Q14254 428 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TECRLQ5HYJ1 363 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARMC3Q5W041 872 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF470Q6ECI4 717 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CNSTQ6PJW8 725 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 KDELC1Q6UW63 502 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 NCSTNQ92542 709 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CASP10Q92851 521 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 DCUN1D1Q96GG9 259 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRPC5OSA6NMA1 111 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 AURKAO14965 403 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 HOXA2O43364 376 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PMPCBO75439 489 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CAPNS1P04632 268 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 GRIA2P42262 883 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PFKPQ01813 784 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PDK3Q15120 406 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MMEL1Q495T6 779 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SH2D4BQ5SQS7 431 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 NXNQ6DKJ4 435 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 KIAA0408Q6ZU52 694 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 METTL23Q86XA0 190 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ICA1LQ8NDH6 482 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 POMKQ9H5K3 350 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 OSER1Q9NX31 292 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 BPTFQ12830 3046 aa23.4■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 PLXNA3P51805 1871 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TNFRSF10BO14763 440 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MSI1O43347 362 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 DENRO43583 198 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CPB1P15086 417 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CCR1P32246 355 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 GATMP50440 423 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 FOLH1Q04609 750 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SULT2A1Q06520 285 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF280DQ6N043 979 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM67Q6ZTA4 783 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHSY3Q70JA7 882 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 SCD5Q86SK9 330 aa23.39■■□□□ 1.34
PCOLCE2-201ENST00000295992 MARVELD2Q8N4S9 558 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms