RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 NPAS4Q8IUM7 802 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 STMN2Q93045 179 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PLK2Q9NYY3 685 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 IL37Q9NZH6 218 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM50BQ9Y247 325 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.89■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM92AA1XBS5 289 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CFLARO15519 480 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHL2O95198 593 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 GOT2P00505 430 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 AOC1P19801 751 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 MAGEA11P43364 429 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 HECTD2Q5U5R9 776 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 28.8
SLC20A1-201ENST00000272542 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 10.9
SLC20A1-201ENST00000272542 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 MATN2O00339 956 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CSRP3P50461 194 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 FSCBQ5H9T9 825 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 DRC3Q9H069 523 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 USP34Q70CQ2 3546 aa15.88■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC162PA2VCL2 907 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 WASH4PA8MWX3 477 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TBC1D4O60343 1298 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TM7SF2O76062 418 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CDK18Q07002 472 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 KLF10Q13118 480 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TAF12Q16514 161 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 UGP2Q16851 508 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 VWA7Q9Y334 891 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 REV3LO60673 3130 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SEMG2Q02383 582 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 BFSP2Q13515 415 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 EFHBQ8N7U6 833 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 RNF208Q9H0X6 261 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 DRGXA6NNA5 263 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 A8MX80 341 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 S1PR4O95977 384 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 VEGFBP49765 207 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 SNX32Q86XE0 403 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAJC28Q9NX36 388 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.87■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 HDAC3O15379 428 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ACSL4O60488 711 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ZXDBP98169 803 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 GNA12Q03113 381 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ESAMQ96AP7 390 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP13A1Q9HD20 1204 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 VPS45Q9NRW7 570 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PRAMEF11O60813 436 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 IGLV3-27P01718 113 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 COX4I1P13073 169 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 NUDT2P50583 147 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PKNOX1P55347 436 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 GALPQ9UBC7 116 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 PHF24Q9UPV7 400 aa15.86■□□□□ 0.13
SLC20A1-201ENST00000272542 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms