RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAKDQ8WVC6 231 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKL2Q92772 493 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP2A3Q93084 1043 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMG2Q969U7 264 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CFAP36Q96G28 342 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SPACA7Q96KW9 195 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SUSD3Q96L08 255 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNAQ96QF7 691 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TWNKQ96RR1 684 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRMDAQ9H2I8 198 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MKS1Q9NXB0 559 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD54BQ9Y620 910 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.15□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.15□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WV48 116 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MTMR11A4FU01 709 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BRJ5 948 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 AP3B1O00203 1094 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF11O14901 512 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 BIRC5O15392 142 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM63AO94886 807 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HAUS5O94927 633 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO21O94952 628 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CD48P09326 243 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ATF6P18850 670 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PRKCHP24723 683 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2F1P24903 491 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN4P29074 926 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 AVPR1AP37288 418 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 P2RY2P41231 377 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS7P49802 495 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF6P49848 677 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 AIF1P55008 147 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GDF10P55107 478 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ORC1Q13415 861 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PDK1Q15118 436 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC1A5Q15758 541 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCCQ15814 346 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 DPYSL2Q16555 572 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ASRGL1Q7L266 308 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP9Q7RTR0 991 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT1Q86TX2 421 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 NAXDQ8IW45 347 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CPA6Q8N4T0 437 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 APPL2Q8NEU8 664 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 USP33Q8TEY7 942 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GIPC2Q8TF65 315 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35F5Q8WV83 523 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf82Q8WW14 230 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGB4Q8WW32 186 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 ERP27Q96DN0 273 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SIKE1Q9BRV8 207 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPN10Q9HC96 672 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 BATF3Q9NR55 127 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 RRN3Q9NYV6 651 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTN3Q9P232 1028 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 MAFFQ9ULX9 164 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.14□□□□□ -1.27
SMARCE1-201ENST00000264640 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.14□□□□□ -1.27
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