RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262829.11

RBFOX2-201, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFOX2, Length 1,538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2-201ENST00000262829 GPR27Q9NS67 375 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 A0A0U1RQS6 177 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TRABD2BA6NFA1 517 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CBFA2T2O43439 604 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 MAFKO60675 156 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CAPNS1P04632 268 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 JUNDP17535 347 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CKMT2P17540 419 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 SERPINA4P29622 427 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 THOP1P52888 689 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PFN3P60673 137 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 DAB2P98082 770 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 BCL2L1Q07817 233 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF235Q14590 738 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 SLC18A3Q16572 532 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 KCTD16Q68DU8 428 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PARGQ86W56 976 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PLA2G15Q8NCC3 412 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 OR4C6Q8NH72 309 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 LMX1AQ8TE12 382 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TEKT4Q8WW24 435 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 OR1A2Q9Y585 309 aa14.66□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 MYLKQ15746 1914 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TSPAN11A1L157 253 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 K7ESM1 405 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 MFSD11O43934 449 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 AKR1B10O60218 316 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 GCATO75600 419 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PROSCO94903 275 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CSF2P04141 144 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 PCCBP05166 539 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 JUPP14923 745 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 MMP12P39900 470 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CYP4F3Q08477 520 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 DPYSL3Q14195 570 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 INPP5AQ14642 412 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 LRRC14Q15048 493 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 HES3Q5TGS1 186 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 DENND2CQ68D51 928 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ERAP2Q6P179 960 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 LZTR1Q8N653 840 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 KCTD6Q8NC69 237 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 APOLD1Q96LR9 279 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 SMIM14Q96QK8 99 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 NOD2Q9HC29 1040 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 SEPT3Q9UH03 358 aa14.65□□□□□ -0.06
RBFOX2-201ENST00000262829 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MFAP3LO75121 409 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 H2AFZP0C0S5 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CSNK1DP48730 415 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ARSEP51690 589 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ELP6Q0PNE2 266 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 RALGDSQ12967 914 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ACACAQ13085 2346 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CAMK2BQ13554 666 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 MESDQ14696 234 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 FAXCQ5TGI0 409 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 H2AFVQ71UI9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PELI3Q8N2H9 469 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ASB12Q8WXK4 309 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 PSKH2Q96QS6 385 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 NT5MQ9NPB1 228 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 U3KQA8 63 aa14.64□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 AQP9O43315 295 aa14.63□□□□□ -0.07
RBFOX2-201ENST00000262829 TNNT1P13805 278 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms