RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 KLF10Q13118 480 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SPDYCQ5MJ68 293 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SPRYD7Q5W111 196 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MFSD5Q6N075 450 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SYT12Q8IV01 421 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ITFG1Q8TB96 612 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CD99L2Q8TCZ2 262 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 UCMAQ8WVF2 138 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MPP4Q96JB8 637 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RHOJQ9H4E5 214 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PIGVQ9NUD9 493 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TRAF6Q9Y4K3 522 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FAM186AA6NE01 2351 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.55□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 H3BN98 237 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MAN1A2O60476 641 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ULK1O75385 1050 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TIPRLO75663 272 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CABYRO75952 493 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ANPEPP15144 967 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ITPKAP23677 461 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 S100A5P33763 92 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DAOAP59103 153 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RUNX1T1Q06455 604 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP1Q07960 439 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FGD3Q5JSP0 725 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LIPMQ5VYY2 423 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OR4L1Q8NH43 312 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TLCD1Q96CP7 247 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF558Q96NG5 402 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 CIB1Q99828 191 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R1Q9NYW7 299 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SIX4Q9UIU6 781 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 E9PAM4 449 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 H0Y858 1186 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NRP1O14786 923 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PLIN3O60664 434 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ATG7O95352 703 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 OR56A5P0C7T3 313 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 MAPK9P45984 424 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 GABRB2P47870 512 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 POLD2P49005 469 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 NEK3P51956 506 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RAD23AP54725 363 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 RPS7P62081 194 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PRKCZQ05513 592 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ATP1A4Q13733 1029 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ITIH5Q86UX2 942 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 FAM228AQ86W67 206 aa5.54□□□□□ -1.52
LMO3-201ENST00000261169 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms