RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NAT16Q8N8M0 369 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TNFSF13BQ9Y275 285 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SOBPA7XYQ1 873 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NRP2O60462 931 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NCAM1P13591 858 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CCNA2P20248 432 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC26A2P50443 739 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MLLT10P55197 1068 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CEP97Q8IW35 865 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 KCNN1Q92952 543 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TOP1MTQ969P6 601 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TAMM41Q96BW9 452 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MAF1Q9H063 256 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ACOT9Q9Y305 439 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 V9GYQ6 96 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DHRS12A0PJE2 317 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SULT1C4O75897 302 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 BAIAP3O94812 1187 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 OXTRP30559 389 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MPP1Q00013 466 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 BFSP2Q13515 415 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SEPT6Q14141 434 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TMEM110Q86TL2 294 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FAM35AQ86V20 835 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 IFNEQ86WN2 208 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PELI3Q8N2H9 469 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 USP3Q9Y6I4 520 aa14.85□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TOMM70O94826 608 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 BCL10O95999 233 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 AHSGP02765 367 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC12A1Q13621 1099 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GRIK4Q16099 956 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC36A3Q495N2 470 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 RDH11Q8TC12 318 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FANCEQ9HB96 536 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 IL18RAPO95256 599 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PGK1P00558 417 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PSMD8P48556 350 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GJA9P57773 515 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MAPRE2Q15555 327 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ARL10Q8N8L6 244 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PPTC7Q8NI37 304 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 RNF139Q8WU17 664 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PHF21BQ96EK2 531 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 OSMRQ99650 979 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 GPR22Q99680 433 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.84□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 KRBA1A5PL33 1030 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 PPEF2O14830 753 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 IL10P22301 178 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 FASP25445 335 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 HK2P52789 917 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 SQLEQ14534 574 aa14.83□□□□□ -0.03
MSI1-201ENST00000257552 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms