RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ETNK2Q9NVF9 386 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 HAO1Q9UJM8 370 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 COL1A2P08123 1366 aa10.6□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 KDELR1P24390 212 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.6□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 CPED1A4D0V7 1026 aa10.59□□□□□ -0.71
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TRPS1-201ENST00000220888 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
TRPS1-201ENST00000220888 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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