RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000036229.12

Ctdp1-201, Transcript of RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdp1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arhgef38Q80VK6 770 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Thnsl2Q80W22 483 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fzd10Q8BKG4 582 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cadm2Q8BLQ9 435 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fra10ac1Q8BP78 315 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aph1bQ8C7N7 257 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Adi1Q99JT9 179 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Adck1Q9D0L4 525 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Lrrc46Q9DAP0 323 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfy2P20662 777 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gria1P23818 907 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dlx2P40764 332 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Man1a1P45700 655 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mfsd14aP70187 490 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pld2P97813 933 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nrg1Q6DR99 700 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gucy2gQ6TL19 1100 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gpr141Q7TQP0 305 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Znf579Q80VM4 562 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Best2Q8BGM5 508 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Aifm2Q8BUE4 373 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ap3m2Q8R2R9 418 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q9D1K7 174 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ap1m2Q9WVP1 423 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mtm1Q9Z2C5 603 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Arhgef10Q8C033 1345 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zcchc7B1AX39 541 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 S100zB9EJL3 99 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Dpysl4O35098 572 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Vps4bP46467 444 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ppp3cbP48453 525 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rit2P70425 217 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Txnl4aP83877 142 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MitfQ08874 526 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm45902Q3UDN3 361 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Mterf2Q8BKY8 385 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gucy1b2Q8BXH3 824 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 2610042L04RikQ9D073 150 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Trpc4apQ9JLV2 797 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Fkbp9Q9Z247 570 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptchd4B9EKX1 904 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nr5a2P45448 560 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tnfaip2Q61333 691 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rpp40Q8R1F9 363 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Abcg3Q99P81 650 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gadd45gip1Q9CR59 222 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Syvn1Q9DBY1 612 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Nmnat1Q9EPA7 285 aa14.71□□□□□ -0.05
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm15155B1B034 138 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm10338K7N692 204 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Matn2O08746 956 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 C2P21180 760 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Npy2rP97295 381 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cyp2c65Q148B1 490 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Q3KNL4 93 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kansl1lQ5DTI6 991 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Il17reQ8BH06 637 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atl1Q8BH66 558 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rab39aQ8BHD0 217 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Rwdd2bQ99M03 290 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cmtm6Q9CZ69 183 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kbtbd6E9PYD7 486 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Kbtbd7G5E8C2 690 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 PolP11369 1281 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Il6raP22272 460 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Clk1P22518 483 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Csf3rP40223 837 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ptgs2Q05769 604 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ccbe1Q3MI99 408 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmem184cQ3TPR7 525 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Vsx2Q61412 361 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr834Q7TRG8 312 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ugt2a1Q80X89 528 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Cep97Q9CZ62 856 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Tmbim6Q9D2C7 237 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Atp5dQ9D3D9 168 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Pgam1Q9DBJ1 254 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Slfn2Q9Z0I6 378 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Gm6351K9J7D1 481 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 MntO08789 591 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Hpcal1P62748 193 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 AxlQ00993 888 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ipcef1Q5DU31 406 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 BegainQ68EF6 600 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Zfp341Q6PGC9 846 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Scd4Q6T707 353 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 SynbQ8BI41 618 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Ebf4Q8K4J2 599 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctdp1-201ENSMUST00000036229 Olfr985Q8VGB4 311 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms