RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637524.1

U6.99-201, humanhuman

BASIC

Gene U6, Length 83 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.99-201ENST00000637524 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.1□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.1□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 ESPNB1AK53 854 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L15C9J2P7 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L10C9JJH3 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L12C9JPN9 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L11C9JVI0 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L21D6R901 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L18D6R9N7 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L22D6RA61 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L19D6RCP7 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L20D6RJB6 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 USP17L24Q0WX57 530 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 CDCA8Q53HL2 280 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 LARGE2Q8N3Y3 721 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 ZNF511Q8NB15 262 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 ZNF516Q92618 1163 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 SIRT1Q96EB6 747 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.09□□□□□ -1.59
U6.99-201ENST00000637524 RASA1P20936 1047 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SSFA2P28290 1259 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 FAM69CQ0P6D2 419 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ERFEQ4G0M1 354 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SIX5Q8N196 739 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 RGS22Q8NE09 1264 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 BAP1Q92560 729 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 TRIM52Q96A61 297 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 NOD1Q9Y239 953 aa5.08□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 OGFOD1Q8N543 542 aa5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 STK32AQ8WU08 396 aa5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.07□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 DKK1O94907 266 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 S1PR4O95977 384 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 PTPN5P54829 565 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 WNT7BP56706 349 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 USP4Q13107 963 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SLC10A4Q96EP9 437 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 DOLKQ9UPQ8 538 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.06□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 M0R2N6 131 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 GGCXP38435 758 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 RPIAP49247 311 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SH3BP2P78314 561 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CLDN10P78369 228 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 KCNC4Q03721 635 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 AGERQ15109 404 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CDAN1Q8IWY9 1227 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 MPNDQ8N594 471 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 FOXJ1Q92949 421 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 HCSTQ9UBK5 93 aa5.05□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CARNS1A5YM72 827 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 DPYDQ12882 1025 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 TSGA10IPQ3SY00 556 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.04□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 SEC13P55735 322 aa5.03□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 GTF2IP78347 998 aa5.03□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 CCDC27Q2M243 656 aa5.03□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.03□□□□□ -1.6
U6.99-201ENST00000637524 RNF223E7ERA6 249 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 ERCC3P19447 782 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 TRIM32Q13049 653 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 LINC01559Q495D7 138 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 CCDC102BQ68D86 513 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.02□□□□□ -1.61
U6.99-201ENST00000637524 CDK15Q96Q40 435 aa5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms