RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 HMOX1P09601 288 aa7.03□□□□□ -1.28
CCL23-202ENST00000613876 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NEUROD2Q15784 382 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CCDC27Q2M243 656 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 EYA1Q99502 592 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 ARHGEF10O15013 1369 aa7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RTL1A6NKG5 1358 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 PRKAR2BP31323 418 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 GOLGA2Q08379 1002 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 WWC1Q8IX03 1113 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.01□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 LTN1O94822 1766 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 TOM1O60784 492 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NEFMP07197 916 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RIPK4P57078 832 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 SLFN5Q08AF3 891 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NFE2L2Q16236 605 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 WDR63Q8IWG1 891 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RGPD1P0DJD0 1748 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 NBPF4Q96M43 638 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.99□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CPDO75976 1380 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 KDRP35968 1356 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 E9PSI1 815 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 COL18A1P39060 1754 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 PIP4K2BP78356 416 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CHRNA2Q15822 529 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 CERKQ8TCT0 537 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RGPD5Q99666 1765 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 KIAA0232Q92628 1395 aa6.96□□□□□ -1.29
CCL23-202ENST00000613876 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 IL16Q14005 1332 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 FAM83GA6ND36 823 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 GAS2L2Q8NHY3 880 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 ABCC6O95255 1503 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 ERBB3P21860 1342 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 NCAPD2Q15021 1401 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 PHLPP1O60346 1717 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 ZNF853P0CG23 659 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 DCTN1Q14203 1278 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 ABCA3Q99758 1704 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 GNAI1P63096 354 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 FKBP8Q14318 412 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 MCM10Q7L590 875 aa6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 NEFLP07196 543 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 EVA1CP58658 441 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 CFAP44Q96MT7 982 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL23-202ENST00000613876 IFT57Q9NWB7 429 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms