RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PTGER2P43116 358 aa27.59■■■□□ 2.01
SGMS1-208ENST00000608287 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.59■■■□□ 2.01
SGMS1-208ENST00000608287 MTFR1LQ9H019 292 aa27.59■■■□□ 2.01
SGMS1-208ENST00000608287 C1QTNF8P60827 252 aa27.58■■■□□ 2.01
SGMS1-208ENST00000608287 SYT17Q9BSW7 474 aa27.58■■■□□ 2.01
SGMS1-208ENST00000608287 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.57■■■□□ 2
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SGMS1-208ENST00000608287 SLC15A2Q16348 729 aa27.54■■■□□ 2
SGMS1-208ENST00000608287 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.54■■■□□ 2
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SGMS1-208ENST00000608287 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.52■■■□□ 2
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SGMS1-208ENST00000608287 SLIT3O75094 1523 aa27.51■■■□□ 2
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SGMS1-208ENST00000608287 EXOC5O00471 708 aa27.44■■□□□ 1.98
SGMS1-208ENST00000608287 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.44■■□□□ 1.98
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SGMS1-208ENST00000608287 COL18A1P39060 1754 aa27.44■■□□□ 1.98
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SGMS1-208ENST00000608287 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
SGMS1-208ENST00000608287 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.43■■□□□ 1.98
SGMS1-208ENST00000608287 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.43■■□□□ 1.98
SGMS1-208ENST00000608287 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.43■■□□□ 1.98
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SGMS1-208ENST00000608287 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.42■■□□□ 1.98
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC7Q96M83 1385 aa27.42■■□□□ 1.98
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SGMS1-208ENST00000608287 TONSLQ96HA7 1378 aa27.38■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 UTRNP46939 3433 aa27.38■■□□□ 1.97
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SGMS1-208ENST00000608287 CABP2Q9NPB3 220 aa27.37■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 PIK3C2AO00443 1686 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.36■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.35■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 CABP1Q9NZU7 370 aa27.34■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 PAPPAQ13219 1627 aa27.34■■□□□ 1.97
SGMS1-208ENST00000608287 POLD1P28340 1107 aa27.33■■□□□ 1.97
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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SGMS1-208ENST00000608287 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.27■■□□□ 1.96
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.24■■□□□ 1.95
SGMS1-208ENST00000608287 KLHL34Q8N239 644 aa27.24■■□□□ 1.95
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SGMS1-208ENST00000608287 GRIN3BO60391 1043 aa27.23■■□□□ 1.95
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SGMS1-208ENST00000608287 NFAT5O94916 1531 aa27.21■■□□□ 1.95
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SGMS1-208ENST00000608287 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.21■■□□□ 1.95
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF827Q17R98 1081 aa27.2■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.18■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 ERBB3P21860 1342 aa27.17■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.17■■□□□ 1.94
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SGMS1-208ENST00000608287 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.15■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.14■■□□□ 1.94
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.13■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.11■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 USP54Q70EL1 1684 aa27.09■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 LTN1O94822 1766 aa27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 USP31Q70CQ4 1352 aa27.08■■□□□ 1.93
SGMS1-208ENST00000608287 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.07■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 ATP10DQ9P241 1426 aa27.05■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.04■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 LY75O60449 1722 aa27.02■■□□□ 1.92
SGMS1-208ENST00000608287 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 HSPA6P17066 643 aa27.01■■□□□ 1.91
SGMS1-208ENST00000608287 CEP350Q5VT06 3117 aa27.01■■□□□ 1.91
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