RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607714.5

TIMM50-220, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM50, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-220ENST00000607714 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.1■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 AKAP12Q02952 1782 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 RGPD5Q99666 1765 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 TONSLQ96HA7 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TIMM50-220ENST00000607714 TMC1Q8TDI8 760 aa23.08■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.07■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 RREB1Q92766 1687 aa23.05■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 NME9Q86XW9 330 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 SBF2Q86WG5 1849 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 PEAK1Q9H792 1746 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 EXOC5O00471 708 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 PLSCR1O15162 318 aa23.03■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 LRRC37A3O60309 1634 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMM50-220ENST00000607714 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 NFAT5O94916 1531 aa22.99■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 SPON1Q9HCB6 807 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 USP31Q70CQ4 1352 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 PROM2Q8N271 834 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.96■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 KCNQ2O43526 872 aa22.96■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.96■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 CCDC7Q96M83 1385 aa22.96■■□□□ 1.27
TIMM50-220ENST00000607714 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.95■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.93■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 SLC24A1O60721 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 BCL9O00512 1426 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 ERBB3P21860 1342 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 TXNRD1Q16881 649 aa22.91■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 A0A1W2PP64 1363 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 LTN1O94822 1766 aa22.89■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 IL2RBP14784 551 aa22.89■■□□□ 1.26
TIMM50-220ENST00000607714 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.89■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 TESK2Q96S53 571 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 ABCC6O95255 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 STK32BQ9NY57 414 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 USP54Q70EL1 1684 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 TNS2Q63HR2 1409 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 ZBTB7AO95365 584 aa22.85■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 IP6K1Q92551 441 aa22.85■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 FBLN1P23142 703 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 SLC15A2Q16348 729 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TIMM50-220ENST00000607714 COG3Q96JB2 828 aa22.82■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.81■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 AMPHP49418 695 aa22.79■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 CASZ1Q86V15 1759 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 YY1P25490 414 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 NHSQ6T4R5 1651 aa22.77■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 PTGER2P43116 358 aa22.77■■□□□ 1.24
TIMM50-220ENST00000607714 HOXC9P31274 260 aa22.76■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 TMF1P82094 1093 aa22.74■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 BTAF1O14981 1849 aa22.74■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 FYB1O15117 783 aa22.73■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.73■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.73■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 MTFR1LQ9H019 292 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 USP47Q96K76 1375 aa22.71■■□□□ 1.23
TIMM50-220ENST00000607714 CDCA8Q53HL2 280 aa22.7■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.69■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF827Q17R98 1081 aa22.69■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 NBPF4Q96M43 638 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 SYT17Q9BSW7 474 aa22.68■■□□□ 1.22
TIMM50-220ENST00000607714 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms