RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587586.5

GTF3C2-AS1-204, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 529 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCDC184Q52MB2 194 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SLIT2O94813 1529 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HOXC9P31274 260 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MIER1Q8N108 512 aa8.64□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RTL1A6NKG5 1358 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AFF2P51816 1311 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ANP32CO43423 234 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IL13P35225 146 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RGPD1P0DJD0 1748 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NRAPQ86VF7 1730 aa8.63□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FLT4P35916 1363 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CCER2I3L3R5 266 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CHRNA2Q15822 529 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NCAPD2Q15021 1401 aa8.62□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SOX12O15370 315 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.61□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLEKHG5O94827 1062 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADAMTS2O95450 1211 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AMPHP49418 695 aa8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ERBB3P21860 1342 aa8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EYA1Q99502 592 aa8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BTG4Q9NY30 223 aa8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NGLY1Q96IV0 654 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NBPF4Q96M43 638 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 KDRP35968 1356 aa8.58□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 VPS72Q15906 364 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.57□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ATRNO75882 1429 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CFAP53Q96M91 514 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 C8orf37Q96NL8 207 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLEKHF1Q96S99 279 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 USP21Q9UK80 565 aa8.56□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.55□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 CRB1P82279 1406 aa8.55□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 FCHSD2O94868 740 aa8.55□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.55□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 DISP2A7MBM2 1401 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GLI3P10071 1580 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 EVA1CP58658 441 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BARGINQ6ZT62 677 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 MRS2Q9HD23 443 aa8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 STRN4Q9NRL3 753 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NUDCQ9Y266 331 aa8.53□□□□□ -1.04
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PHACTR3Q96KR7 559 aa8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-204ENST00000587586 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms