RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.55■■■□□ 2.32
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PPP4C-211ENST00000567642 NME9Q86XW9 330 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-211ENST00000567642 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.53■■■□□ 2.32
PPP4C-211ENST00000567642 USP54Q70EL1 1684 aa29.53■■■□□ 2.32
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PPP4C-211ENST00000567642 USP47Q96K76 1375 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-211ENST00000567642 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.42■■■□□ 2.3
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PPP4C-211ENST00000567642 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-211ENST00000567642 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4C-211ENST00000567642 PEAK1Q9H792 1746 aa29.42■■■□□ 2.3
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PPP4C-211ENST00000567642 CCDC7Q96M83 1385 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4C-211ENST00000567642 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4C-211ENST00000567642 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.36■■■□□ 2.29
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PPP4C-211ENST00000567642 EXOC5O00471 708 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4C-211ENST00000567642 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.3■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF14Q5TI25 921 aa29.29■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 CDCA8Q53HL2 280 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.28■■■□□ 2.28
PPP4C-211ENST00000567642 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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PPP4C-211ENST00000567642 FBLN1P23142 703 aa29.23■■■□□ 2.27
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PPP4C-211ENST00000567642 HOXC9P31274 260 aa29.19■■■□□ 2.26
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PPP4C-211ENST00000567642 RTL1A6NKG5 1358 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-211ENST00000567642 PROM2Q8N271 834 aa29.1■■■□□ 2.25
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PPP4C-211ENST00000567642 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.03■■■□□ 2.24
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PPP4C-211ENST00000567642 NBPF4Q96M43 638 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-211ENST00000567642 STK32BQ9NY57 414 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-211ENST00000567642 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 CASZ1Q86V15 1759 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 MEGF6O75095 1541 aa29■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PPP4C-211ENST00000567642 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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