RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-211ENST00000559850 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.69■□□□□ 0.9
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RABGGTA-211ENST00000559850 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.69■□□□□ 0.9
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RABGGTA-211ENST00000559850 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.57■□□□□ 0.88
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RABGGTA-211ENST00000559850 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.53■□□□□ 0.88
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RABGGTA-211ENST00000559850 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.52■□□□□ 0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 PDE3BQ13370 1112 aa20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.51■□□□□ 0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.5■□□□□ 0.87
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 DISP2A7MBM2 1401 aa20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-211ENST00000559850 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 NHSQ6T4R5 1651 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-211ENST00000559850 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.29■□□□□ 0.84
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