RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-233ENST00000552688 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-233ENST00000552688 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-233ENST00000552688 NUP188Q5SRE5 1749 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 TXNRD1Q16881 649 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 STK32BQ9NY57 414 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 SLIT3O75094 1523 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 SLC15A2Q16348 729 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 CCDC7Q96M83 1385 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 PTGER2P43116 358 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 MTFR1LQ9H019 292 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 PEAK1Q9H792 1746 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 ZBTB7AO95365 584 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 SYT17Q9BSW7 474 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 LRRC37A3O60309 1634 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-233ENST00000552688 SOX12O15370 315 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 IL2RBP14784 551 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ARXQ96QS3 562 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ERBB3P21860 1342 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ABCC6O95255 1503 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 USP31Q70CQ4 1352 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 COL18A1P39060 1754 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 TNS2Q63HR2 1409 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 CASZ1Q86V15 1759 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 MAP3K5Q99683 1374 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 PIK3C2AO00443 1686 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SBF2Q86WG5 1849 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 NFAT5O94916 1531 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 POLD1P28340 1107 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 TERF2IPQ9NYB0 399 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-233ENST00000552688 C1QTNF8P60827 252 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 GPR162Q16538 588 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 NME9Q86XW9 330 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 SLC24A1O60721 1099 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 NEUROD1Q13562 356 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 TMC1Q8TDI8 760 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 IP6K1Q92551 441 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 AKT1S1Q96B36 256 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 MYOM1P52179 1685 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 AKAP12Q02952 1782 aa9.7□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 ZNF827Q17R98 1081 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.69□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 WNK3Q9BYP7 1800 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 NHSQ6T4R5 1651 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa9.68□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 GRIN3BO60391 1043 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 KLHL34Q8N239 644 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 COG3Q96JB2 828 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 PAPPAQ13219 1627 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 AMPHP49418 695 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-233ENST00000552688 RGPD5Q99666 1765 aa9.65□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PP64 1363 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-233ENST00000552688 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
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