RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 CBLBQ13191 982 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRQ-204ENST00000549355 PODNQ7Z5L7 613 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRQ-204ENST00000549355 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRQ-204ENST00000549355 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 ACDQ96AP0 544 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 MBIPQ9NS73 344 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP10Q9P2G4 905 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 IGF1RP08069 1367 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 COL8A1P27658 744 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 CTHP32929 405 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 NDUFV2P19404 249 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP2K5Q13163 448 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF217Q8TC41 542 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 P3H3Q8IVL6 736 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 IRF6O14896 467 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 MTMR2Q13614 643 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 AGERQ15109 404 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 CFAP99D6REC4 459 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 OIP5O43482 229 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRQ-204ENST00000549355 GPR25O00155 361 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 CLCN1P35523 988 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 RELBQ01201 579 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 DBN1Q16643 649 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 GMCL1Q96IK5 515 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 CD163Q86VB7 1156 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRQ-204ENST00000549355 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 ERFEQ4G0M1 354 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC102AQ96A19 550 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 GJA5P36382 358 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 CHRNA4P43681 627 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 LCE1DQ5T752 114 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRQ-204ENST00000549355 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 HRCP23327 699 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 DOC2BQ14184 412 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIN2CQ14957 1233 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 ARTNQ5T4W7 220 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 MX2P20592 715 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 NBPF14Q5TI25 921 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 RHOQP17081 205 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRQ-204ENST00000549355 ADH1AP07327 375 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 PTGIRP43119 386 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 LILRA1O75019 489 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRQ-204ENST00000549355 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms