RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538734.6

MIR9-3HG-202, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 2

Gene MIR9-3HG, Length 1,877 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.89■■□□□ 1.9
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.88■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RTL1A6NKG5 1358 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRKAR2BP31323 418 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NEUROD2Q15784 382 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GOLGA2Q08379 1002 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WWC1Q8IX03 1113 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IP6K1Q92551 441 aa26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PLEKHG5O94827 1062 aa26.86■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CCDC27Q2M243 656 aa26.85■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.85■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.85■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ARHGEF10O15013 1369 aa26.84■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NEFMP07197 916 aa26.83■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.83■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.82■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.81■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SLFN5Q08AF3 891 aa26.81■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.81■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 EYA1Q99502 592 aa26.8■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.79■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.79■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.78■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 WDR63Q8IWG1 891 aa26.78■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RIPK4P57078 832 aa26.77■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.77■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.76■■□□□ 1.88
MIR9-3HG-202ENST00000538734 E9PSI1 815 aa26.76■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.75■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NFE2L2Q16236 605 aa26.75■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KDRP35968 1356 aa26.75■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.74■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.72■■□□□ 1.87
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CPDO75976 1380 aa26.68■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.68■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NBPF4Q96M43 638 aa26.68■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.68■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TOM1O60784 492 aa26.67■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.67■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD5Q99666 1765 aa26.67■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NEFLP07196 543 aa26.66■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL18A1P39060 1754 aa26.66■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.66■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 KIAA0232Q92628 1395 aa26.65■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IL16Q14005 1332 aa26.64■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.64■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.64■■□□□ 1.86
MIR9-3HG-202ENST00000538734 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.64■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.63■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FKBP8Q14318 412 aa26.63■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CHRNA2Q15822 529 aa26.62■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.62■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ERBB3P21860 1342 aa26.62■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCC6O95255 1503 aa26.62■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ABCA3Q99758 1704 aa26.6■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NCAPD2Q15021 1401 aa26.58■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PIP4K2BP78356 416 aa26.58■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.57■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.57■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM83GA6ND36 823 aa26.57■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.56■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.56■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 DCTN1Q14203 1278 aa26.54■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.54■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 PHLPP1O60346 1717 aa26.54■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.53■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.52■■□□□ 1.84
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 ZNF853P0CG23 659 aa26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 IFT57Q9NWB7 429 aa26.51■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 GNAI1P63096 354 aa26.5■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 MCM10Q7L590 875 aa26.5■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 CERKQ8TCT0 537 aa26.5■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
MIR9-3HG-202ENST00000538734 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
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