RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	GOLIM4	O00461	696 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	SAMD9	Q5K651	1589 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	APAF1	O14727	1248 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	CDCA8	Q53HL2	280 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	GTF3C6	Q969F1	213 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	DONSON	Q9NYP3	566 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	TDO2	P48775	406 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	STK26	Q9P289	416 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	MCC	P23508	829 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	TEX35	Q5T0J7	233 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	SPC24	Q8NBT2	197 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	DEF6	Q9H4E7	631 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	IRF6	O14896	467 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	TPM3	P06753	285 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A1B0GUL7	405 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	SUFU	Q9UMX1	484 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.89
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF217	Q8TC41	542 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	E2F4	Q16254	413 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN26	Q16670	478 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF592	Q92610	1267 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	IQGAP2	Q13576	1575 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM4A	O75164	1064 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP2B1	P20020	1258 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	IFT57	Q9NWB7	429 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ELF2	Q15723	593 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ATG3	Q9NT62	314 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SRL	Q86TD4	932 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM212A	Q96EL1	285 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	GRIN2A	Q12879	1464 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP2R1A	P30153	589 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TICAM2	Q86XR7	235 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	MNS1	Q8NEH6	495 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	RAD50	Q92878	1312 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PACS2	Q86VP3	889 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	NPHP1	O15259	732 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SEMA3F	Q13275	785 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SGSM3	Q96HU1	749 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	LNPK	Q9C0E8	428 aa		9.43	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PTGS1	P23219	599 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	GPS2	Q13227	327 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	RABEP1	Q15276	862 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	MED4	Q9NPJ6	270 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF853	P0CG23	659 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FBLN2	P98095	1184 aa		9.42	□□□□□ -0.9

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