RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 NR3C2P08235 984 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 ABL2P42684 1182 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 TIMP2P16035 220 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 RAB15P59190 212 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF592Q92610 1267 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 COG6Q9Y2V7 657 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 RAD21O60216 631 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 IRF5Q13568 498 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 DACH1Q9UI36 760 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 ITPKCQ96DU7 683 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 HOMEZQ8IX15 550 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 VAC14Q08AM6 782 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 POM121Q96HA1 1249 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 BMP1P13497 986 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 WASHC4Q2M389 1173 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 WWC1Q8IX03 1113 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF787Q6DD87 383 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ESPNB1AK53 854 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 POTECB2RU33 542 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 RNF20Q5VTR2 975 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 SENP2Q9HC62 589 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRC-214ENST00000530727 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 UPP2O95045 317 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 SCARF1Q14162 830 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 MEIOBQ8N635 442 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CBLBQ13191 982 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 SEMA3FQ13275 785 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM52Q96A61 297 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC125Q86Z20 511 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 KIFC2Q96AC6 838 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 BMP2P12643 396 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 SOX11P35716 441 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP42Q96MM3 310 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CYLDQ9NQC7 956 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZVU0 165 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM47Q96LD4 638 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 LILRA1O75019 489 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 RNF135Q8IUD6 432 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 RELBQ01201 579 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 ADH1AP07327 375 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-214ENST00000530727 POM121CA8CG34 1229 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ERVK-9P63128 1117 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 A6NJR5 290 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SCTRP47872 440 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ALG2Q9H553 416 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SPINT1O43278 529 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 C14orf37Q86TY3 774 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 MAN1A2O60476 641 aa7.3□□□□□ -1.24
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