RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 NLRP6P59044 892 aa23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 PTGER2P43116 358 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 AKAP12Q02952 1782 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3-206ENST00000530405 MYOM1P52179 1685 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB7AO95365 584 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 CABP2Q9NPB3 220 aa23.76■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 UTRNP46939 3433 aa23.75■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 CABP1Q9NZU7 370 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.73■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 TXNRD1Q16881 649 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 STK32BQ9NY57 414 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 PIK3C2AO00443 1686 aa23.72■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC15A2Q16348 729 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.7■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 SYT17Q9BSW7 474 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 MTFR1LQ9H019 292 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 RGPD5Q99666 1765 aa23.68■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 CHD4Q14839 1912 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.67■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 EXOC5O00471 708 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.66■■□□□ 1.38
PACSIN3-206ENST00000530405 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.64■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC7Q96M83 1385 aa23.63■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 NHSQ6T4R5 1651 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 TNS2Q63HR2 1409 aa23.61■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 EVC2Q86UK5 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 ABCC6O95255 1503 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP3K5Q99683 1374 aa23.6■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 NFAT5O94916 1531 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 ARXQ96QS3 562 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 PAPPAQ13219 1627 aa23.59■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 C1QTNF8P60827 252 aa23.58■■□□□ 1.37
PACSIN3-206ENST00000530405 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-206ENST00000530405 SOX12O15370 315 aa23.57■■□□□ 1.36
PACSIN3-206ENST00000530405 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-206ENST00000530405 BTAF1O14981 1849 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-206ENST00000530405 ERBB3P21860 1342 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF827Q17R98 1081 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 IL2RBP14784 551 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 GPR162Q16538 588 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 USP31Q70CQ4 1352 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 USP54Q70EL1 1684 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-206ENST00000530405 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 AKT1S1Q96B36 256 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 LTN1O94822 1766 aa23.44■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.43■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 POLD1P28340 1107 aa23.42■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACSIN3-206ENST00000530405 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 NME9Q86XW9 330 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 KLHL34Q8N239 644 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 CEP350Q5VT06 3117 aa23.38■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.37■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 IFFO2Q5TF58 517 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.36■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.35■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACSIN3-206ENST00000530405 LY75O60449 1722 aa23.32■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 GRIN3BO60391 1043 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 IP6K1Q92551 441 aa23.3■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNQ4P56696 695 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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