RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529423.1

REPS1-215, Transcript of RALBP1 associated Eps domain containing 1, human

TSL 3

Gene REPS1, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REPS1-215	ENST00000529423	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	ERCC3	P19447	782 aa		7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	GUCA2A	Q02747	115 aa		7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	SEMA3F	Q13275	785 aa		7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	ALG2	Q9H553	416 aa		7.63	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	UNCX	A6NJT0	531 aa		7.62	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	RPIA	P49247	311 aa		7.62	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		7.61	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	FOXC1	Q12948	553 aa		7.61	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	PNMA1	Q8ND90	353 aa		7.61	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.61	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	MMP16	P51512	607 aa		7.6	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.6	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		7.6	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	FDX1	P10109	184 aa		7.59	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		7.59	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
REPS1-215	ENST00000529423	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		7.58	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	ATP9B	O43861	1147 aa		7.57	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.57	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	GPR37L1	O60883	481 aa		7.56	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	MTMR2	Q13614	643 aa		7.56	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		7.56	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		7.56	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	AVP	P01185	164 aa		7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TRIM32	Q13049	653 aa		7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		7.55	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	C6orf229	H3BNL8	230 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	JUND	P17535	347 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	AXIN1	O15169	862 aa		7.53	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		7.53	□□□□□ -1.2
REPS1-215	ENST00000529423	CYP4X1	Q8N118	509 aa		7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	WNT7A	O00755	349 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	TCF3	P15923	654 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	GIPC2	Q8TF65	315 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	BCL11A	Q9H165	835 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.51	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.5	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.5	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		7.49	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	CFAP99	D6REC4	459 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SKI	P12755	728 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	NR6A1	Q15406	480 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	DRC1	Q96MC2	740 aa		7.48	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	FAM196B	A6NMK8	535 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L15	C9J2P7	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L10	C9JJH3	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L12	C9JPN9	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L11	C9JVI0	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L21	D6R901	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L18	D6R9N7	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L22	D6RA61	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L19	D6RCP7	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L20	D6RJB6	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SSFA2	P28290	1259 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	SKOR1	P84550	965 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	USP17L24	Q0WX57	530 aa		7.47	□□□□□ -1.21
REPS1-215	ENST00000529423	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21

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