RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 USP6P35125 1406 aa20.59■□□□□ 0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 NLRP6P59044 892 aa20.58■□□□□ 0.89
UBASH3B-202ENST00000525711 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CABP2Q9NPB3 220 aa20.56■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.54■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 BCL9O00512 1426 aa20.54■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.53■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.52■□□□□ 0.88
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB7AO95365 584 aa20.51■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 STK32BQ9NY57 414 aa20.51■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CABP1Q9NZU7 370 aa20.51■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 NHSQ6T4R5 1651 aa20.51■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 UTRNP46939 3433 aa20.5■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.49■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.49■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.48■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.48■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCC6O95255 1503 aa20.48■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 TXNRD1Q16881 649 aa20.47■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 PROM2Q8N271 834 aa20.47■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.47■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 EXOC5O00471 708 aa20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 PTGER2P43116 358 aa20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC15A2Q16348 729 aa20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 EVC2Q86UK5 1308 aa20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC7Q96M83 1385 aa20.46■□□□□ 0.87
UBASH3B-202ENST00000525711 TNS2Q63HR2 1409 aa20.45■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 LTN1O94822 1766 aa20.45■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.45■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 BTAF1O14981 1849 aa20.44■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 MTFR1LQ9H019 292 aa20.44■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.44■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 NFAT5O94916 1531 aa20.43■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.43■□□□□ 0.86
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UBASH3B-202ENST00000525711 SYT17Q9BSW7 474 aa20.42■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.42■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 PAPPAQ13219 1627 aa20.41■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.4■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 USP54Q70EL1 1684 aa20.4■□□□□ 0.86
UBASH3B-202ENST00000525711 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
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UBASH3B-202ENST00000525711 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.35■□□□□ 0.85
UBASH3B-202ENST00000525711 MAP3K5Q99683 1374 aa20.34■□□□□ 0.85
UBASH3B-202ENST00000525711 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.34■□□□□ 0.85
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
UBASH3B-202ENST00000525711 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.33■□□□□ 0.85
UBASH3B-202ENST00000525711 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.32■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.32■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 ERBB3P21860 1342 aa20.31■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 IL2RBP14784 551 aa20.31■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.31■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 C1QTNF8P60827 252 aa20.3■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.29■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 USP31Q70CQ4 1352 aa20.29■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 GPR162Q16538 588 aa20.28■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
UBASH3B-202ENST00000525711 POLD1P28340 1107 aa20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF827Q17R98 1081 aa20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 LY75O60449 1722 aa20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.26■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 KLHL34Q8N239 644 aa20.25■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.25■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.24■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.23■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.23■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 NME9Q86XW9 330 aa20.22■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 AKT1S1Q96B36 256 aa20.21■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.21■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.21■□□□□ 0.83
UBASH3B-202ENST00000525711 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.19■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.19■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 TMC1Q8TDI8 760 aa20.19■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.19■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.18■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.18■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.16■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.15■□□□□ 0.82
UBASH3B-202ENST00000525711 NEUROD1Q13562 356 aa20.14■□□□□ 0.81
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