RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.84■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.84■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.84■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.83■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 PANK3Q9H999 370 aa22.83■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.83■■□□□ 1.25
HACE1-211ENST00000521962 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 ABCC6O95255 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.81■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.8■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 COG3Q96JB2 828 aa22.8■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 LTN1O94822 1766 aa22.79■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 DISP2A7MBM2 1401 aa22.78■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.78■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 FBLN1P23142 703 aa22.77■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.77■■□□□ 1.24
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.77■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 STRN4Q9NRL3 753 aa22.76■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 BAG6P46379 1132 aa22.75■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 RGPD5Q99666 1765 aa22.74■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.74■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 PEAK1Q9H792 1746 aa22.72■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.72■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 NSD2O96028 1365 aa22.71■■□□□ 1.23
HACE1-211ENST00000521962 A0A0G2JS52 829 aa22.7■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 MYT1Q01538 1121 aa22.7■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 CRB1P82279 1406 aa22.7■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 RTL1A6NKG5 1358 aa22.69■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 ERBB3P21860 1342 aa22.68■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.68■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 EVA1CP58658 441 aa22.67■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 FAM182BQ5T319 152 aa22.67■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.67■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 HOXC9P31274 260 aa22.66■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 IP6K1Q92551 441 aa22.66■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 USP35Q9P2H5 1018 aa22.65■■□□□ 1.22
HACE1-211ENST00000521962 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.64■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.64■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 RREB1Q92766 1687 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 BARGINQ6ZT62 677 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 FLT4P35916 1363 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.62■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 AMPHP49418 695 aa22.61■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.61■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.61■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.6■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 POLKQ9UBT6 870 aa22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 LRRC37A3O60309 1634 aa22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 INSRP06213 1382 aa22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 MORC1Q86VD1 984 aa22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.58■■□□□ 1.21
HACE1-211ENST00000521962 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.55■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.55■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.55■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 TRIM37O94972 964 aa22.53■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HACE1-211ENST00000521962 NCAPD2Q15021 1401 aa22.5■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.5■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 NBPF4Q96M43 638 aa22.5■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 TNS2Q63HR2 1409 aa22.48■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 MEGF6O75095 1541 aa22.48■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 APBA3O96018 575 aa22.47■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.47■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.46■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HACE1-211ENST00000521962 IL2RBP14784 551 aa22.45■■□□□ 1.18
HACE1-211ENST00000521962 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HACE1-211ENST00000521962 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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