RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.77□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 MORC1Q86VD1 984 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 DLC1Q96QB1 1528 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 TULP4Q9NRJ4 1543 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 PDE3BQ13370 1112 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ATP7BP35670 1465 aa6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 A0A1W2PP64 1363 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 SBNO1A3KN83 1393 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 LRP6O75581 1613 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 CGNL1Q0VF96 1302 aa6.74□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 USP6P35125 1406 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.73□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 FYB1O15117 783 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 POLA2Q14181 598 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 BARGINQ6ZT62 677 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 PXDNQ92626 1479 aa6.72□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.71□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.71□□□□□ -1.33
CLVS1-205ENST00000519846 NEUROD2Q15784 382 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.7□□□□□ -1.34
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CLVS1-205ENST00000519846 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SOCS7O14512 581 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 DDB1Q16531 1140 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.7□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 VPS72Q15906 364 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 EXOC5O00471 708 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 RGS22Q8NE09 1264 aa6.69□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 TRIM37O94972 964 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 GSE1Q14687 1217 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC7Q96M83 1385 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 USP32Q8NFA0 1604 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 HMOX1P09601 288 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 KIF1AQ12756 1690 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 HOXC9P31274 260 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 TATP17735 454 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 MTHFSP49914 203 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 IP6K1Q92551 441 aa6.67□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 APBA3O96018 575 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 CFAP53Q96M91 514 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 USP19O94966 1318 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 ADGRB2O60241 1585 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.66□□□□□ -1.34
CLVS1-205ENST00000519846 IL2RBP14784 551 aa6.65□□□□□ -1.34
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