RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDR1P51861 262 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TOPBP1Q92547 1522 aa21.49■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPC24Q8NBT2 197 aa21.48■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TNMDQ9H2S6 317 aa21.48■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.48■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.48■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.48■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.48■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAPKBP1O60336 1514 aa21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATP2B1P20020 1258 aa21.47■■□□□ 1.03
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FCHSD2O94868 740 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 XBP1P17861 261 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FAM177BA6PVY3 158 aa21.45■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMC2O95347 1197 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RAPGEF3O95398 923 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYCE3A1L190 88 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ABCC11Q96J66 1382 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.44■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SIL1Q9H173 461 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PDILTQ8N807 584 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DYNC1I1O14576 645 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MTMR7Q9Y216 660 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IFT140Q96RY7 1462 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SRGAP3O43295 1099 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STK38Q15208 465 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NFE2L2Q16236 605 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.4■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SMARCE1Q969G3 411 aa21.4■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.39■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STK3Q13188 491 aa21.39■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ERLIN1O75477 346 aa21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAP3K11Q16584 847 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.37■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 STRN4Q9NRL3 753 aa21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UVSSAQ2YD98 709 aa21.36■■□□□ 1.01
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