RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF14Q5TI25 921 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZVU0 165 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.57□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTSQ03393 145 aa10.56□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL8A6PVC2 850 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDRGK1Q96HY6 314 aa10.55□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPINT1O43278 529 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CARD14Q9BXL6 1004 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35F4A4IF30 521 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS8Q9UP79 889 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL27Q8NEV9 243 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WHAMMQ8TF30 809 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.48□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASSF7Q02833 373 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGBL1Q96MI9 1066 aa10.47□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.46□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.46□□□□□ -0.73
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLURP2P0DP57 97 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.45□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGEF15O94989 841 aa10.44□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDF11O95390 407 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGA6P23229 1130 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOPCQ9HD26 462 aa10.43□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR6A1Q15406 480 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VWA5B2Q8N398 1253 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC10A4Q96EP9 437 aa10.42□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF217Q8TC41 542 aa10.41□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RELBQ01201 579 aa10.4□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.4□□□□□ -0.74
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPS8L1Q8TE68 723 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.39□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LILRA1O75019 489 aa10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP2R2DQ66LE6 453 aa10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB33Q86T24 672 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SVOPQ8N4V2 548 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAM32Q8TC27 787 aa10.37□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SV2AQ7L0J3 742 aa10.36□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAS6Q14393 721 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPSM3Q9Y4H4 160 aa10.35□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDC14CA4D256 554 aa10.34□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADH1AP07327 375 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTK2Q05397 1052 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.33□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESPNB1AK53 854 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.32□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS2O95450 1211 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRS1P35568 1242 aa10.31□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGIRP43119 386 aa10.3□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NBPF20Q3BBV1 942 aa10.28□□□□□ -0.76
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AP1G2O75843 785 aa10.27□□□□□ -0.77
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFC5P40937 340 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms