RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 PTPN5P54829 565 aa8.59□□□□□ -1.03
MFSD1-217ENST00000489639 PTCH1Q13635 1447 aa8.59□□□□□ -1.03
MFSD1-217ENST00000489639 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.59□□□□□ -1.03
MFSD1-217ENST00000489639 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 ARHGAP33O14559 1287 aa8.58□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 PSEN2P49810 448 aa8.58□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.57□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 ADGRB2O60241 1585 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 PTPRUQ92729 1446 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 TMC1Q8TDI8 760 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 MRS2Q9HD23 443 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.56□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 USP32Q8NFA0 1604 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 NLRP13Q86W25 1043 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 CDK19Q9BWU1 502 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.55□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 ATP7BP35670 1465 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 NSD2O96028 1365 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.54□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 TK2O00142 265 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 KLHL34Q8N239 644 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.53□□□□□ -1.04
MFSD1-217ENST00000489639 A0A1W2PP64 1363 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 KCNA6P17658 529 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 HSPA2P54652 639 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC184Q52MB2 194 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.51□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 INSRP06213 1382 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 NWD1Q149M9 1564 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CABP1Q9NZU7 370 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.5□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PPP2R1AP30153 589 aa8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 MORC1Q86VD1 984 aa8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 FAM9BQ8IZU0 186 aa8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.48□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 KIF3CO14782 793 aa8.47□□□□□ -1.05
MFSD1-217ENST00000489639 C2orf72A6NCS6 295 aa8.46□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.46□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 CFAP53Q96M91 514 aa8.45□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 ITSN1Q15811 1721 aa8.45□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.45□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 FYB1O15117 783 aa8.44□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 AKAP12Q02952 1782 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 SLC34A2O95436 690 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 C14orf37Q86TY3 774 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 ACEP12821 1306 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 USP6P35125 1406 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.43□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 DCCP43146 1447 aa8.42□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.41□□□□□ -1.06
MFSD1-217ENST00000489639 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.41□□□□□ -1.06
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