RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	FCHSD2	O94868	740 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	TRIM27	P14373	513 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	KRT85	P78386	507 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		18.78	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	TNMD	Q9H2S6	317 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	FANCA	O15360	1455 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		18.77	■□□□□ 0.6
MEGF6-205	ENST00000485002	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		18.77	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	TRDN	Q13061	729 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	DISP1	Q96F81	1524 aa		18.76	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PLCH2	O75038	1416 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SMC2	O95347	1197 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.75	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	APP	P05067	770 aa		18.74	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	NFE2L2	Q16236	605 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		18.73	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	NLRP6	P59044	892 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PSME1	Q06323	249 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	HIP1	O00291	1037 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	PDILT	Q8N807	584 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		18.72	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	IDI1	Q13907	227 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	ABCC11	Q96J66	1382 aa		18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
MEGF6-205	ENST00000485002	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		18.71	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	SAMD9	Q5K651	1589 aa		18.7	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	CBX1	P83916	185 aa		18.7	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.7	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		18.7	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	MCM5	P33992	734 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	CLSTN1	O94985	981 aa		18.69	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	STK3	Q13188	491 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	ANKRD1	Q15327	319 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	CCP110	O43303	1012 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	USP25	Q9UHP3	1055 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	NUP160	Q12769	1436 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	SPATA32	Q96LK8	384 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	NOS1	P29475	1434 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	SEC24B	O95487	1268 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEGF6-205	ENST00000485002	STK38	Q15208	465 aa		18.66	■□□□□ 0.58

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