RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484918.1

MRPL23-209, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, human

TSL 5

Gene MRPL23, Length 232 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL23-209	ENST00000484918	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	AKT1S1	Q96B36	256 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MRPL23-209	ENST00000484918	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	CLTCL1	P53675	1640 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	NHS	Q6T4R5	1651 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	BTAF1	O14981	1849 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
MRPL23-209	ENST00000484918	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	EVA1C	P58658	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	DDB1	Q16531	1140 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	CNTNAP1	P78357	1384 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	CFAP44	Q96MT7	982 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	PIK3C2A	O00443	1686 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	DAPK1	P53355	1430 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	CRB1	P82279	1406 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	MSL1	Q68DK7	614 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	COL18A1	P39060	1754 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	SBF1	O95248	1867 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	VEGFB	P49765	207 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	CPD	O75976	1380 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	KIF1B	O60333	1816 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	USP6	P35125	1406 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	USP54	Q70EL1	1684 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	LY75	O60449	1722 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPL23-209	ENST00000484918	PPL	O60437	1756 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	MPND	Q8N594	471 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	KCNQ4	P56696	695 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	STK26	Q9P289	416 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	SOX10	P56693	466 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	MSH5	O43196	834 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	MEGF6	O75095	1541 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	ABCC6	O95255	1503 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	BCS1L	Q9Y276	419 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPL23-209	ENST00000484918	COL6A3	P12111	3177 aa		10.08	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms