RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 CHRNA4P43681 627 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 GUCA2AQ02747 115 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 PHOX2BQ99453 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 FOXJ1Q92949 421 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 LAMC2Q13753 1193 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 GPR25O00155 361 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-204ENST00000468347 FSHRP23945 695 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 TXKP42681 527 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 FZD5Q13467 585 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 MCTP1Q6DN14 999 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 Q6ZVU0 165 aa6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 CBLBQ13191 982 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.45□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 RNF217Q8TC41 542 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 GMCL1Q96IK5 515 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 RRAGCQ9HB90 399 aa6.44□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 GNPATO15228 680 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 LRP8Q14114 963 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.43□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 PAX4O43316 350 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 GATA4P43694 442 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM22Q8IYM9 498 aa6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 MX2P20592 715 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.4□□□□□ -1.38
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf229H3BNL8 230 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PIK3R2O00459 728 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 GNB5O14775 395 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 DYRK3O43781 588 aa6.39□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 AGERQ15109 404 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 DBN1Q16643 649 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.37□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 CTHP32929 405 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 TRERF1Q96PN7 1200 aa6.36□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 MAP2K3P46734 347 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 RELBQ01201 579 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 DESI1Q6ICB0 168 aa6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 FDX1P10109 184 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 PRR7Q8TB68 274 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-204ENST00000468347 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 GPR37O15354 613 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 AMPD1P23109 780 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 KLRG1Q96E93 195 aa6.3□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 H7C1W4 665 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 MAP10Q9P2G4 905 aa6.29□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 LYPD8Q6UX82 237 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-204ENST00000468347 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 RHOQP17081 205 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 DGKGP49619 791 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.26□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.25□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.24□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.24□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 BTBD6Q96KE9 485 aa6.23□□□□□ -1.41
SHQ1-204ENST00000468347 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.22□□□□□ -1.41
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