RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		12.28	□□□□□ -0.44
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ALS2	Q96Q42	1657 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PITPNM1	O00562	1244 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.27	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ITSN1	Q15811	1721 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLRP13	Q86W25	1043 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.26	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TRIM37	O94972	964 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIAA0232	Q92628	1395 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADGRB1	O14514	1584 aa		12.25	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ABTB2	Q8N961	1025 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.24	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CPD	O75976	1380 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDK19	Q9BWU1	502 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPON1	Q9HCB6	807 aa		12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.23	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.22	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ACE	P12821	1306 aa		12.21	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.21	□□□□□ -0.45
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.2	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHRNA2	Q15822	529 aa		12.2	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAM182B	Q5T319	152 aa		12.2	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KLHL34	Q8N239	644 aa		12.2	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLSCR1	O15162	318 aa		12.19	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	YY1	P25490	414 aa		12.19	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KCNQ2	O43526	872 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	GC	P02774	474 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP19	O94966	1318 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EVX2	Q03828	476 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DDB1	Q16531	1140 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRB1	P82279	1406 aa		12.16	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPOCK2	Q92563	424 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TONSL	Q96HA7	1378 aa		12.15	□□□□□ -0.46
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NLRP6	P59044	892 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.14	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		12.13	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	BCL9	O00512	1426 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RREB1	Q92766	1687 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	EXOC5	O00471	708 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CREBZF	Q9NS37	354 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CABP1	Q9NZU7	370 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USP6	P35125	1406 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48

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