RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 COG3Q96JB2 828 aa20.46■□□□□ 0.87
SH3BP1-205ENST00000466097 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 USP35Q9P2H5 1018 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 CRB1P82279 1406 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 NSD3Q9BZ95 1437 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 BARGINQ6ZT62 677 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP1-205ENST00000466097 EP400Q96L91 3159 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 FYB1O15117 783 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC125Q86Z20 511 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 ERBB3P21860 1342 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 IP6K1Q92551 441 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC7Q96M83 1385 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 AMPHP49418 695 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 RTL1A6NKG5 1358 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 PDE3BQ13370 1112 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 PANK3Q9H999 370 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC37A3O60309 1634 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 FBLN1P23142 703 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXC9P31274 260 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP1-205ENST00000466097 NSD2O96028 1365 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 DDB1Q16531 1140 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM182BQ5T319 152 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SH3BP1-205ENST00000466097 DISP2A7MBM2 1401 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 FLT4P35916 1363 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BP1-205ENST00000466097 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 SBF2Q86WG5 1849 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 IL2RBP14784 551 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 INSRP06213 1382 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP1-205ENST00000466097 TNS2Q63HR2 1409 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 EXOC5O00471 708 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 BAG6P46379 1132 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM37O94972 964 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 MORC1Q86VD1 984 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 POLKQ9UBT6 870 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 BCL9O00512 1426 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 NBPF4Q96M43 638 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 APBA3O96018 575 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 MEGF6O75095 1541 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 NHSQ6T4R5 1651 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP1-205ENST00000466097 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 RREB1Q92766 1687 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP1-205ENST00000466097 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
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