RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 YY1P25490 414 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 SMPD1P17405 629 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 DISP1Q96F81 1524 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 HLA-CQ95604 372 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.78□□□□□ -1
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXA2O43364 376 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 IQGAP2Q13576 1575 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.77□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 J3QL48 77 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CLCN1P35523 988 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC102AQ96A19 550 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 WFS1O76024 890 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 PLA2R1Q13018 1463 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ARID3CA6NKF2 412 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 GUCA2AQ02747 115 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 JUNDP17535 347 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RXRBP28702 533 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 WNT7BP56706 349 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SKOR1P84550 965 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 HECW1Q76N89 1606 aa8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP10AO60312 1499 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.71□□□□□ -1.01
RABGGTB-203ENST00000459697 HPS1Q92902 700 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 SENP2Q9HC62 589 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP350Q5VT06 3117 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 LRP5O75197 1615 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 RETREG3Q86VR2 466 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 ALDH1A1P00352 501 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM47Q96LD4 638 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 C6orf229H3BNL8 230 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 FDX1P10109 184 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA8O94911 1581 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 KIFC2Q96AC6 838 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 EP400Q96L91 3159 aa8.65□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 NPATQ14207 1427 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 IGF1RP08069 1367 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 SIAH2O43255 324 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 MS4A1P11836 297 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 WIPF1O43516 503 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 RGS12O14924 1447 aa8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 SH3BP2P78314 561 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.61□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP10BO94823 1461 aa8.6□□□□□ -1.03
RABGGTB-203ENST00000459697 NDUFV2P19404 249 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms