RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450625.1

SH3BP5-207, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 763 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-207ENST00000450625 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 NBPF14Q5TI25 921 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 LRRC37A3O60309 1634 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 TMC1Q8TDI8 760 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 SBF2Q86WG5 1849 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP5-207ENST00000450625 PEAK1Q9H792 1746 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 TONSLQ96HA7 1378 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 NFAT5O94916 1531 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 NME9Q86XW9 330 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-207ENST00000450625 EXOC5O00471 708 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 PLSCR1O15162 318 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 LTN1O94822 1766 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 USP31Q70CQ4 1352 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 CCDC7Q96M83 1385 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 ABCC6O95255 1503 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 USP54Q70EL1 1684 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP5-207ENST00000450625 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 SPON1Q9HCB6 807 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 BCL9O00512 1426 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 A0A1W2PP64 1363 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 ERBB3P21860 1342 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 KCNQ2O43526 872 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 PROM2Q8N271 834 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 TNS2Q63HR2 1409 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP5-207ENST00000450625 IL2RBP14784 551 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 TXNRD1Q16881 649 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 TESK2Q96S53 571 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 SLC24A1O60721 1099 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 STK32BQ9NY57 414 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 NHSQ6T4R5 1651 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 CASZ1Q86V15 1759 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 IP6K1Q92551 441 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 COG3Q96JB2 828 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-207ENST00000450625 ZBTB7AO95365 584 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 SLC15A2Q16348 729 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 FBLN1P23142 703 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 AMPHP49418 695 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 BTAF1O14981 1849 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP5-207ENST00000450625 TMF1P82094 1093 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 HOXC9P31274 260 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 USP47Q96K76 1375 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 YY1P25490 414 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 PTGER2P43116 358 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 MYOM1P52179 1685 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP5-207ENST00000450625 FYB1O15117 783 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 MTFR1LQ9H019 292 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 CDCA8Q53HL2 280 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 PAPPAQ13219 1627 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 RTL1A6NKG5 1358 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 ZNF827Q17R98 1081 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 NBPF4Q96M43 638 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP5-207ENST00000450625 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms