RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNPHO15079 494 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.69□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIK3R4Q99570 1358 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KANK1Q14678 1352 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 E9PCH4 1651 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEP350Q5VT06 3117 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEUROD2Q15784 382 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLIT2O94813 1529 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UTRNP46939 3433 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP32Q8NFA0 1604 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf72A6NCS6 295 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXK1P85037 733 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BARGINQ6ZT62 677 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCC5O15440 1437 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCA3Q99758 1704 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF3CO14782 793 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMBP2O15034 1052 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PXDNQ92626 1479 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RREB1Q92766 1687 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSG2Q14126 1118 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOK7Q18PE1 504 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ORAI2Q96SN7 254 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METP08581 1390 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRAPQ86VF7 1730 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPYSL4O14531 572 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEPT12Q8IYM1 358 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHD4Q14839 1912 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAG6P46379 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDIA6Q15084 440 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DAPK1P53355 1430 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D12O60347 775 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLPP6Q8IY26 295 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRL2O95490 1459 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADGRB2O60241 1585 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DISP2A7MBM2 1401 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM182BQ5T319 152 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AK7Q96M32 723 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC34A2O95436 690 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYOM1P52179 1685 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1QTNF8P60827 252 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CASZ1Q86V15 1759 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS72Q15906 364 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A0G2JS52 829 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF1AQ12756 1690 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.51□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXO3O43524 673 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms