RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RIMS2Q9UQ26 1411 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.62■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 RIPK4P57078 832 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 KIF2CQ99661 725 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.61■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 MED14O60244 1454 aa18.6■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.59■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
TOP3B-206ENST00000436282 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.58■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.57■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 HMOX1P09601 288 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 GCC1Q96CN9 775 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 POLKQ9UBT6 870 aa18.56■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TPM2P07951 284 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 PRKAR2BP31323 418 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 REREQ9P2R6 1566 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NME9Q86XW9 330 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.55■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 METP08581 1390 aa18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF428Q96B54 188 aa18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 AGLP35573 1532 aa18.53■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 SSFA2P28290 1259 aa18.52■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.52■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
TOP3B-206ENST00000436282 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.52■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.52■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3R4Q99570 1358 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 FCHSD2O94868 740 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 NUTM2FA1L443 756 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.51■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PTCH1Q13635 1447 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.5■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.49■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CDC45O75419 566 aa18.48■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.47■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.47■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 COG3Q96JB2 828 aa18.46■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 DLC1Q96QB1 1528 aa18.46■□□□□ 0.55
TOP3B-206ENST00000436282 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.46■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ATP7BP35670 1465 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF445P59923 1031 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SIRT2Q8IXJ6 389 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ZMYND15Q9H091 742 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 RABEP1Q15276 862 aa18.45■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP44Q96MT7 982 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 AK9Q5TCS8 1911 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 VAMP4O75379 141 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 NFE2L2Q16236 605 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC4O15439 1325 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 TNRQ92752 1358 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 OFD1O75665 1012 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 NUCB2P80303 420 aa18.44■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.43■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 IL13P35225 146 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.42■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
TOP3B-206ENST00000436282 SOX12O15370 315 aa18.41■□□□□ 0.54
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