RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 TNRQ92752 1358 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.74■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 ZFYVE9O95405 1425 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 NLRP6P59044 892 aa24.73■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.72■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 F6X3S4 739 aa24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TTLL3-210ENST00000427220 GSE1Q14687 1217 aa24.69■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.68■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 NLRP1Q9C000 1473 aa24.66■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 SLC4A2P04920 1241 aa24.66■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CFAP44Q96MT7 982 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 IFT57Q9NWB7 429 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 IL16Q14005 1332 aa24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.64■■□□□ 1.54
TTLL3-210ENST00000427220 CPS1P31327 1500 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 USP35Q9P2H5 1018 aa24.63■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.62■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 ABTB2Q8N961 1025 aa24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 SIRT2Q8IXJ6 389 aa24.6■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.6■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 SMC5Q8IY18 1101 aa24.6■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 DIP2BQ9P265 1576 aa24.6■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 G2E3Q7L622 706 aa24.59■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 KCNA6P17658 529 aa24.59■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 NUCB1Q02818 461 aa24.58■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.58■■□□□ 1.53
TTLL3-210ENST00000427220 HSCBQ8IWL3 235 aa24.57■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 MEIS3Q99687 375 aa24.57■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 AAMPQ13685 434 aa24.56■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 EYA1Q99502 592 aa24.54■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TTLL3-210ENST00000427220 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF853P0CG23 659 aa24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 ANXA1P04083 346 aa24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.5■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 ATP7BP35670 1465 aa24.49■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.48■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 STK31Q9BXU1 1019 aa24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 USP32Q8NFA0 1604 aa24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TTLL3-210ENST00000427220 ADGRB2O60241 1585 aa24.45■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 PSME1Q06323 249 aa24.44■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 GCC1Q96CN9 775 aa24.44■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 CHL1O00533 1208 aa24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 PTPRUQ92729 1446 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 MSH6P52701 1360 aa24.42■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 ABCC4O15439 1325 aa24.41■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 MED14O60244 1454 aa24.4■■□□□ 1.5
TTLL3-210ENST00000427220 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms