RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 XBP1P17861 261 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF7Q2M1P5 1343 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCAO15360 1455 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 HMOX1P09601 288 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 DCTN1Q14203 1278 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC7Q96M83 1385 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 STAC3Q96MF2 364 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 BRMS1Q9HCU9 246 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 RICTORQ6R327 1708 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC66A2RUB6 948 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 MSH5O43196 834 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 GNAI3P08754 354 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CAGE1Q8TC20 777 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 GLI2P10070 1586 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2R1Q13018 1463 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTROBQ8N137 903 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 FSD1Q9BTV5 496 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF13AQ9H1H9 1805 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 DIP2BQ9P265 1576 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 EPS15P42566 896 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PSME1Q06323 249 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 RABEP1Q15276 862 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2B1P20020 1258 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 FIBPO43427 364 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC27Q2M243 656 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PCH4 1651 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP7AQ04656 1500 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 SART3Q15020 963 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPY26PQ9H489 355 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 BRPF3Q9ULD4 1205 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC2O95347 1197 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CCP110O43303 1012 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 MTHFSP49914 203 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 RDXP35241 583 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ERBINQ96RT1 1412 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCE1Q969G3 411 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO6Q9UM54 1294 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA6Q8N139 1617 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CDCA7LQ96GN5 454 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE3AQ14432 1141 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 STK38Q15208 465 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP74Q9C0B2 1584 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 95.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRL1O94910 1474 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 JMYQ8N9B5 988 aa13.1□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 HIP1O00291 1037 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 FYB1O15117 783 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 TXLNAP40222 546 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 AFAP1Q8N556 730 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 GCC1Q96CN9 775 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 LEKR1Q6ZMV7 388 aa13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
EFTUD2-202ENST00000426333 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC192P0DO97 292 aa13.08□□□□□ -0.32
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms