RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 CARD14Q9BXL6 1004 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 SLIT3O75094 1523 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 KIAA0232Q92628 1395 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.22■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 FAM83GA6ND36 823 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HPS1-205ENST00000414009 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 FYB1O15117 783 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 CPDO75976 1380 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 USP54Q70EL1 1684 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 CHRNA2Q15822 529 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.19■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 BTG4Q9NY30 223 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 SLIT2O94813 1529 aa20.17■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 EVA1CP58658 441 aa20.16■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HPS1-205ENST00000414009 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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HPS1-205ENST00000414009 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.14■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 NFAT5O94916 1531 aa20.13■□□□□ 0.81
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HPS1-205ENST00000414009 RXRBP28702 533 aa20.13■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 STRN4Q9NRL3 753 aa20.13■□□□□ 0.81
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HPS1-205ENST00000414009 AMPHP49418 695 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 VPS72Q15906 364 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 MORC1Q86VD1 984 aa20.1■□□□□ 0.81
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HPS1-205ENST00000414009 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS1-205ENST00000414009 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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HPS1-205ENST00000414009 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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HPS1-205ENST00000414009 COL18A1P39060 1754 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 FBLN1P23142 703 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 RTL1A6NKG5 1358 aa20.04■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 A0A0G2JS52 829 aa20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 PRR29P0C7W0 189 aa20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 MYT1Q01538 1121 aa20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 RGPD5Q99666 1765 aa20.03■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 HOXC9P31274 260 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 USP35Q9P2H5 1018 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.02■□□□□ 0.8
HPS1-205ENST00000414009 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.02■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.01■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 CRB1P82279 1406 aa20.01■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 FLT4P35916 1363 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 CHADLQ6NUI6 762 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 ILDR2Q71H61 639 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 ERBB3P21860 1342 aa19.99■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.98■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
HPS1-205ENST00000414009 GLI3P10071 1580 aa19.98■□□□□ 0.79
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