RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 MMP14P50281 582 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RABEP1Q15276 862 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 YY1AP1Q9H869 796 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 SMTNL1A8MU46 457 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 SART3Q15020 963 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 OSCARQ8IYS5 282 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 SIRT1Q96EB6 747 aa11.51□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ELF2Q15723 593 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CDCA8Q53HL2 280 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 KIF14Q15058 1648 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 LRMPQ12912 555 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ST18O60284 1047 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CYP2C19P33261 490 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ICE2Q659A1 982 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 MBD5Q9P267 1494 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.5□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 KDM4AO75164 1064 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP11.49□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 10.8
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 UVSSAQ2YD98 709 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 LCMT1Q9UIC8 334 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 MYO1CO00159 1063 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 E2F4Q16254 413 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 TEX35Q5T0J7 233 aa11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CASQ1P31415 396 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 NUCB1Q02818 461 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 NCAPGQ9BPX3 1015 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGEF11O15085 1522 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 CDC45O75419 566 aa11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-203ENST00000395211 TRIM27P14373 513 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 USP48Q86UV5 1035 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 POLKQ9UBT6 870 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 CEP135Q66GS9 1140 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 AP5Z1O43299 807 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 APBB1O00213 710 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TESK2Q96S53 571 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 NUP155O75694 1391 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF446Q9NWS9 450 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TPM3P06753 285 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 FAM212AQ96EL1 285 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 PZPP20742 1482 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 NEK4P51957 841 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 SYCP1Q15431 976 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN26Q16670 478 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 CCDC183Q5T5S1 534 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 DEF6Q9H4E7 631 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 ST5P78524 1137 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 CTR9Q6PD62 1173 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 CEP83Q9Y592 693 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 REC8O95072 547 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-203ENST00000395211 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms