RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 PROM2Q8N271 834 aa19.38■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 SOX12O15370 315 aa19.36■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.35■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.35■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.35■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 WNK3Q9BYP7 1800 aa19.34■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.33■□□□□ 0.69
TTPAL-203ENST00000372906 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.33■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 CASZ1Q86V15 1759 aa19.32■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 EVC2Q86UK5 1308 aa19.32■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 ZBTB7AO95365 584 aa19.31■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.31■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 AKAP12Q02952 1782 aa19.31■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.31■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa19.3■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.3■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 PTGER2P43116 358 aa19.28■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 TXNRD1Q16881 649 aa19.28■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.28■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.28■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 BCL9O00512 1426 aa19.27■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 EXOC5O00471 708 aa19.27■□□□□ 0.68
TTPAL-203ENST00000372906 NFAT5O94916 1531 aa19.25■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.25■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 TTC21AQ8NDW8 1320 aa19.25■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 MYOM1P52179 1685 aa19.24■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 NEUROD1Q13562 356 aa19.24■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 SLC15A2Q16348 729 aa19.24■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.23■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 STK32BQ9NY57 414 aa19.23■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 UTRNP46939 3433 aa19.22■□□□□ 0.67
TTPAL-203ENST00000372906 CCDC7Q96M83 1385 aa19.2■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 NME9Q86XW9 330 aa19.2■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.2■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 TNS2Q63HR2 1409 aa19.19■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 SYT17Q9BSW7 474 aa19.19■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 NLRP2Q9NX02 1062 aa19.19■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 MON2Q7Z3U7 1717 aa19.18■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 SGIP1Q9BQI5 828 aa19.18■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 ERBB3P21860 1342 aa19.17■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 NHSQ6T4R5 1651 aa19.17■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.16■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 MTFR1LQ9H019 292 aa19.16■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 USP31Q70CQ4 1352 aa19.16■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 LTN1O94822 1766 aa19.16■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa19.15■□□□□ 0.66
TTPAL-203ENST00000372906 BTAF1O14981 1849 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 IL2RBP14784 551 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 TMC1Q8TDI8 760 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC4BQ9NT99 713 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 ABCC6O95255 1503 aa19.14■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF827Q17R98 1081 aa19.13■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 PAPPAQ13219 1627 aa19.12■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 USP54Q70EL1 1684 aa19.11■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 ARXQ96QS3 562 aa19.11■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.09■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 CHD4Q14839 1912 aa19.08■□□□□ 0.65
TTPAL-203ENST00000372906 KCNQ4P56696 695 aa19.08■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 FBLN1P23142 703 aa19.07■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 AKT1S1Q96B36 256 aa19.06■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PP64 1363 aa19.06■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 IP6K1Q92551 441 aa19.05■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.03■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 RGPD2P0DJD1 1756 aa19.02■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
TTPAL-203ENST00000372906 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 GPR162Q16538 588 aa19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 KLHL34Q8N239 644 aa19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 MAP3K5Q99683 1374 aa19.01■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.99■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.99■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.99■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.98■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 HOXC9P31274 260 aa18.98■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.98■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.97■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 NSD2O96028 1365 aa18.97■□□□□ 0.63
TTPAL-203ENST00000372906 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms