RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SRGAP3O43295 1099 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC184Q52MB2 194 aa24.17■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 SIL1Q9H173 461 aa24.16■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 TXLNAP40222 546 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 SLFN5Q08AF3 891 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.15■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 PDILTQ8N807 584 aa24.14■■□□□ 1.46
CCSAP-203ENST00000366687 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 TSPY26PQ9H489 355 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 EPS15P42566 896 aa24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 MYL6BP14649 208 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.13■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM22Q8IYM9 498 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL34Q8N239 644 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 KDM4AO75164 1064 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.12■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD11A6QL63 1104 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 AACSQ86V21 672 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 RUFY1Q96T51 708 aa24.11■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 CDR1P51861 262 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.1■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 KRT85P78386 507 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.09■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.08■■□□□ 1.45
CCSAP-203ENST00000366687 SMC2O95347 1197 aa24.08■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ODF2Q5BJF6 829 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 WDR97A6NE52 1622 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.07■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC192P0DO97 292 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 KRT32Q14532 448 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 AK7Q96M32 723 aa24.06■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 STK3Q13188 491 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 SMARCE1Q969G3 411 aa24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ME1P48163 572 aa24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ABCC11Q96J66 1382 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CCP110O43303 1012 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.03■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGEF11O15085 1522 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC69A6NI79 296 aa24.02■■□□□ 1.44
CCSAP-203ENST00000366687 CDKL5O76039 1030 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 TNMDQ9H2S6 317 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 KIF1BPQ96EK5 621 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 CAGE1Q8TC20 777 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 KRT18P05783 430 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP45Q9UL16 551 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms