RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.91□□□□□ -1.62
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L5A8MUK1 530 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ESPNB1AK53 854 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATG7O95352 703 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SKIP12755 728 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIRT1Q96EB6 747 aa4.9□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC19A1P41440 591 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SKOR1P84550 965 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDK15Q96Q40 435 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USTQ9Y2C2 406 aa4.89□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 A0A0G2JS52 829 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L3A6NCW0 530 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L4A6NCW7 530 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIK3CDO00329 1044 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 WNT7AO00755 349 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 RFX1P22670 979 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 EML3Q32P44 896 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L2Q6R6M4 530 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRIM50Q86XT4 487 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM196BA6NMK8 535 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIAH2O43255 324 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATP1A2P50993 1020 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP4Q13107 963 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 NCOA4Q13772 614 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPRYD7Q5W111 196 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 NOD1Q9Y239 953 aa4.86□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 NR5A1Q13285 461 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 LARGE2Q8N3Y3 721 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 RETREG2Q8NC44 543 aa4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 RGS20O76081 388 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.84□□□□□ -1.63
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L15C9J2P7 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L10C9JJH3 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L13C9JLJ4 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L12C9JPN9 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L11C9JVI0 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L21D6R901 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L18D6R9N7 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L22D6RA61 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L17D6RBQ6 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L19D6RCP7 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L20D6RJB6 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADH1CP00326 375 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 RASA1P20936 1047 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 GRM5P41594 1212 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L24Q0WX57 530 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 PTK7Q13308 1070 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ERVK-9P63128 1117 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ARID5BQ14865 1188 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 ANKMY2Q8IV38 441 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 SIX5Q8N196 739 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 OGFOD1Q8N543 542 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 M0R2N6 131 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 BRD1O95696 1058 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD56.1-201ENST00000362913 FSHRP23945 695 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms