RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPNDQ8N594 471 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK15Q96Q40 435 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH1A1P00352 501 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMPD1P17405 629 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRM5P41594 1212 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 POM121CA8CG34 1229 aa5.38□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 WWC1Q8IX03 1113 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.37□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAK2O60296 914 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NR3C2P08235 984 aa5.36□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 HPS1Q92902 700 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.36□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 NNTQ13423 1086 aa5.35□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 ALG2Q9H553 416 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX11P35716 441 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBPF20Q3BBV1 942 aa5.34□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.34□□□□□ -1.55
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RNU6-227P-201ENST00000362865 SLFNL1Q499Z3 407 aa5.29□□□□□ -1.56
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RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
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RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.29□□□□□ -1.56
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RNU6-227P-201ENST00000362865 GSK3AP49840 483 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBLBQ13191 982 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
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