RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHG5O94827 1062 aa31.42■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 HOXC9P31274 260 aa31.42■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa31.42■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 GCP02774 474 aa31.41■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 RTL1A6NKG5 1358 aa31.41■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.4■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 NEUROD2Q15784 382 aa31.39■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.39■■■□□ 2.62
TMIE-201ENST00000326431 PRKAR2BP31323 418 aa31.38■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.35■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF10O15013 1369 aa31.35■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 WWC1Q8IX03 1113 aa31.35■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA2Q08379 1002 aa31.34■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 IP6K1Q92551 441 aa31.34■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF25Q86VW2 580 aa31.33■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 RGPD5Q99666 1765 aa31.32■■■□□ 2.61
TMIE-201ENST00000326431 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.32■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 ZBTB7CA1YPR0 619 aa31.32■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 AEBP1Q8IUX7 1158 aa31.32■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 CCDC27Q2M243 656 aa31.31■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 SULT6B1Q6IMI4 303 aa31.31■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 PHACTR3Q96KR7 559 aa31.3■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 RGPD2P0DJD1 1756 aa31.29■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 NEFMP07197 916 aa31.29■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 IGSF1Q8N6C5 1336 aa31.28■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 CABLES1Q8TDN4 633 aa31.28■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 EYA1Q99502 592 aa31.28■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 SLFN5Q08AF3 891 aa31.27■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 ABCA3Q99758 1704 aa31.27■■■□□ 2.6
TMIE-201ENST00000326431 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.26■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 KDRP35968 1356 aa31.24■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 COL18A1P39060 1754 aa31.24■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 RIPK4P57078 832 aa31.24■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.24■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 NFE2L2Q16236 605 aa31.23■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 WDR63Q8IWG1 891 aa31.22■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 E9PSI1 815 aa31.21■■■□□ 2.59
TMIE-201ENST00000326431 AXIN2Q9Y2T1 843 aa31.19■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 ABCC6O95255 1503 aa31.16■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa31.15■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 CPDO75976 1380 aa31.15■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 ANKRD24Q8TF21 1146 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 KIAA0232Q92628 1395 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 NBPF6Q5VWK0 638 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 USHBP1Q8N6Y0 703 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 NBPF4Q96M43 638 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.14■■■□□ 2.58
TMIE-201ENST00000326431 NEFLP07196 543 aa31.13■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 PHLPP1O60346 1717 aa31.13■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 FKBP8Q14318 412 aa31.1■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 CHRNA2Q15822 529 aa31.1■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 TOM1O60784 492 aa31.1■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 ERBB3P21860 1342 aa31.09■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 RNF123Q5XPI4 1314 aa31.09■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 LMO7Q8WWI1 1683 aa31.09■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 NCAPD2Q15021 1401 aa31.09■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 IL16Q14005 1332 aa31.08■■■□□ 2.57
TMIE-201ENST00000326431 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.07■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.05■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 FAM83GA6ND36 823 aa31.04■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 PIP4K2BP78356 416 aa31.04■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 PRDM11Q9NQV5 511 aa31.03■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 FANCIQ9NVI1 1328 aa31.01■■■□□ 2.56
TMIE-201ENST00000326431 DCTN1Q14203 1278 aa31.01■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 GAS2L2Q8NHY3 880 aa31.01■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 UBAP1LF5GYI3 381 aa31■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.95■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 MCM10Q7L590 875 aa30.95■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.95■■■□□ 2.55
TMIE-201ENST00000326431 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 IFT57Q9NWB7 429 aa30.93■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 LRRC37A3O60309 1634 aa30.93■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 ZNF853P0CG23 659 aa30.92■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 GNAI1P63096 354 aa30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms