RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300013.8

SAAL1-201, Transcript of serum amyloid A like 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene SAAL1, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAAL1-201ENST00000300013 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.49■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 CCDC27Q2M243 656 aa24.48■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 HOXC9P31274 260 aa24.47■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 ARHGEF10O15013 1369 aa24.47■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 GCP02774 474 aa24.46■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 PRKAR2BP31323 418 aa24.46■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.46■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.46■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 HMOX1P09601 288 aa24.45■■□□□ 1.51
SAAL1-201ENST00000300013 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.45■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 NEUROD2Q15784 382 aa24.45■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 WWC1Q8IX03 1113 aa24.45■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 IP6K1Q92551 441 aa24.44■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 NEFLP07196 543 aa24.43■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 WDR63Q8IWG1 891 aa24.41■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 E9PSI1 815 aa24.4■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 SLFN5Q08AF3 891 aa24.4■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.4■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.4■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.4■■□□□ 1.5
SAAL1-201ENST00000300013 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.38■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 RIPK4P57078 832 aa24.37■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 NFE2L2Q16236 605 aa24.37■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.37■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.37■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 PLEKHG5O94827 1062 aa24.36■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.36■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.35■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.35■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 EYA1Q99502 592 aa24.35■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 KDRP35968 1356 aa24.35■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.35■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 ABCC6O95255 1503 aa24.33■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.33■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.33■■□□□ 1.49
SAAL1-201ENST00000300013 RGPD5Q99666 1765 aa24.32■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.32■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 IL16Q14005 1332 aa24.3■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.3■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 COL18A1P39060 1754 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 ABCA3Q99758 1704 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 CPDO75976 1380 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 FKBP8Q14318 412 aa24.29■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.28■■□□□ 1.48
SAAL1-201ENST00000300013 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.25■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.25■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 TOM1O60784 492 aa24.25■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 NBPF4Q96M43 638 aa24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 KIAA0232Q92628 1395 aa24.23■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 NCAPD2Q15021 1401 aa24.22■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 ERBB3P21860 1342 aa24.21■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.2■■□□□ 1.47
SAAL1-201ENST00000300013 PHLPP1O60346 1717 aa24.2■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.19■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.19■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.18■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.18■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 GNAI1P63096 354 aa24.16■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 CHRNA2Q15822 529 aa24.16■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 IFT57Q9NWB7 429 aa24.16■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SAAL1-201ENST00000300013 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 FAM83GA6ND36 823 aa24.13■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.13■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 CFAP44Q96MT7 982 aa24.12■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.11■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.11■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 ZNF853P0CG23 659 aa24.11■■□□□ 1.45
SAAL1-201ENST00000300013 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms