RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CBFA2T2O43439 604 aa28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ESPNB1AK53 854 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ATF3P18847 181 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ABTB2Q8N961 1025 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA32Q96LK8 384 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.61■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT18P05783 430 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.6■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SIL1Q9H173 461 aa28.6■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM177BA6PVY3 158 aa28.59■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.59■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAM1Q96QH2 718 aa28.59■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.59■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ERLIN1O75477 346 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 HFM1A2PYH4 1435 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 ERLIN2O94905 339 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 SYCP1Q15431 976 aa28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.58■■■□□ 2.17
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GNPTAB-201ENST00000299314 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.57■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.57■■■□□ 2.16
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GNPTAB-201ENST00000299314 DEF6Q9H4E7 631 aa28.56■■■□□ 2.16
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GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC69A6NI79 296 aa28.56■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 STIM1Q13586 685 aa28.56■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.56■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CFTRP13569 1480 aa28.56■■■□□ 2.16
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GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.55■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC184Q52MB2 194 aa28.54■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP57L1Q8IYX8 460 aa28.54■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0754O94854 1291 aa28.54■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
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GNPTAB-201ENST00000299314 AACSQ86V21 672 aa28.53■■■□□ 2.16
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GNPTAB-201ENST00000299314 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.52■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.51■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.51■■■□□ 2.16
GNPTAB-201ENST00000299314 TXLNBQ8N3L3 684 aa28.51■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK19Q9BWU1 502 aa28.51■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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GNPTAB-201ENST00000299314 SYCE3A1L190 88 aa28.5■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 ARAP1Q96P48 1450 aa28.5■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN30Q86W11 494 aa28.49■■■□□ 2.15
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GNPTAB-201ENST00000299314 CABP1Q9NZU7 370 aa28.48■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.48■■■□□ 2.15
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GNPTAB-201ENST00000299314 CDKL5O76039 1030 aa28.47■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF428Q96B54 188 aa28.47■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFN5Q08AF3 891 aa28.47■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.47■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 AFAP1Q8N556 730 aa28.47■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 PLCD4Q9BRC7 762 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 SMTNL1A8MU46 457 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM132AQ24JP5 1023 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 NEFHP12036 1026 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM193AP78312 1265 aa28.46■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K11Q16584 847 aa28.46■■■□□ 2.15
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GNPTAB-201ENST00000299314 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCEQ6IPM2 695 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.45■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT32Q14532 448 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCL2Q8N4E4 241 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ZHX3Q9H4I2 956 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.44■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.43■■■□□ 2.14
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GNPTAB-201ENST00000299314 CENPHQ9H3R5 247 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL6BP14649 208 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR97A6NE52 1622 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CAMK4Q16566 473 aa28.42■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.41■■■□□ 2.14
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